Ein Mitochondrium kommt in den meisten Zellen vor. Es ist für die Energiebereitstellung und für die Synthese von Proteinen zuständig. Es besitzt eine Doppelmembran die das innere des Mitochondriums von dem Intermembranraum trennt. Diese Kompartimentierung, also die räumliche Trennung ist wichtig, um zum Beispiel einen Protonengradienten also den Unterschied an der Protonenverteilung im Inneren und dem Intermembranraum des Mitochondriums zu schaffen. Das ist zum Beispiel für die produktion von ATP wichtig. Durch die Christae (Einstülpungen) der inneren Mitochondrienmembran wird deren Oberfläche vergrößert. Diese Oberflächenvergößerung ist auch für viele Prozesse in dem Mitochondrium wichtig. Das Innere des Mitochondriumd ist mit einer Flüssigkeit gefüllt die man Matrix nennt. In ihr befindet sich die DNA und Ribosomen, die für die Proteinsynthese wichtig sind.
